Свою историю Рыбинская Мариинская женская гимназия начала в 1848 году, будучи училищем с одним классом, в котором учились 22 девушки.
Позже учебное заведение стало трехклассным. В 1870 году училище было преобразовано в прогимназию, а в 1875 — в гимназию. В начале ХХ века там учились уже 642 девушки.
После закрытия в 1918 году в здании гимназии располагались несколько школ. В 1922 году там появилась девятилетка, с 31-го года — десятилетка имени Бубнова. А в декабре 1938 года была образована школа №3 имение Ломоносова.
За время своей работы постройка множество раз перестраивалась в связи с расширением классов. В последние годы здание на улице Ломоносова опустело и сейчас не используется. Школа №3 переехала на улицу Глеба Успенского.